研究人员发现老鼠衰老过程的分子特征
研究人员已经确定了老鼠衰老过程的分子特征,他们的研究结果今天发表在开放获取的《eLife》杂志上。
他们的分析为哺乳动物不同组织的不同类型细胞的衰老分子特征提供了最全面的特征之一,并将有助于未来对衰老和相关主题的研究。
衰老导致主要器官的衰退,是许多疾病的主要危险因素,包括癌症、心血管和神经退行性疾病。虽然先前的研究强调了衰老过程的不同特征,但潜在的分子和细胞机制仍不清楚。
为了更好地理解这些机制,Tabula Muris联盟创建了单细胞转录组数据集,称为Tabula Muris Senis (TMS)。TMS包含来自雄性和雌性小鼠23个组织和器官的30多万个注释细胞。“这些细胞是从不同年龄的老鼠身上收集的,这使得这些数据成为研究不同组织和细胞类型衰老的遗传基础的巨大机会,”第一作者、美国哈佛大学流行病学系博士后研究员Martin Jinye Zhang说。
最初的TMS研究主要探索衰老的细胞中心效应,旨在描述不同组织中细胞类型组成的变化。在当前以基因为中心的研究中,Zhang和他的同事专注于不同细胞类型在衰老过程中发生的基因表达变化。
利用TMS数据,他们在23个组织的76种细胞类型中发现了衰老依赖基因。然后,他们描述了这些基因的衰老行为,这些基因在所有细胞类型(“全局”)中都是共有的,并且对不同的组织细胞具有特异性。
然后,研究小组利用这种协调的活动来开发基于全球衰老基因的单细胞衰老评分。这种新的高分辨率衰老评分揭示了同一动物中不同的组织细胞类型可能具有不同的衰老状态,从而揭示了不同类型细胞的不同衰老过程。
“总的来说,我们的研究结果提供了小鼠多种组织细胞类型中衰老基因的特征,”资深作者James Zou总结道,他是美国斯坦福大学生物医学数据科学助理教授,也是Chan Zuckerberg生物中心的研究员。“除了提供关于衰老过程的新的生物学见解外,这项工作还为相关领域的研究人员提供了全面的参考。”
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